윈도우 2000 으로 설치 되었을 경우에는 Fdisk 으로 파티션을 제거 할 수 없습니다.
그렇기 때문에 CD 로 부팅 하여 파티션을 제거 해야만 합니다.

자세한 설명입니다.

CD-ROM으로 시스템을 시동을 하기 위해서는 먼저 시스템 바이오스(BIOS)에서 드라이브의 시동 순서를 변경해 주어야 합니다. 시스템 바이오스(BIOS)에 관련된 부분은 해당 컴퓨터 제조 업체로 문의하시기 바랍니다.

1. Windows 2000 설치 CD를 CD-ROM 드라이브에 넣고 시스템을 재 시작합니다.
CD-ROM 시동을 위해서 모니터 화면에 나타나는 지시에 따릅니다.

예) 화면에 아래와 같은 메시지가 나타날 수 있으며, 이 때 아무 키나 누르면 CD-ROM으로 시동이 진행됩니다.

Press any key to boot from CD-ROM

2. 설치 프로그램을 시작합니다. 화면이 나타나면 ENTER 키를 누릅니다.

3. 최종 사용자 사용권 계약서에 동의하기 위하여 F8 키를 누릅니다.

4. 키보드 종류 선택화면에서 ENTER 키를 누릅니다.

5. "다음 목록은 이 컴퓨터의 현재 파티션과 분할되지 않은 공간을 나타냅니다." 라는 내용이 화면에 나타나고 화면 하단에는 현재 파티션 정보가 표시됩니다. 방향 키로 삭제하기 원하는 드라이브를 선택하고 "D" 키를 누릅니다.

6. 삭제하려는 파티션이 시스템 파티션(Windows 2000이 설치되어 시동되는 파티션: 주로 C 드라이브) 일 경우는 "삭제하려는 파티션은 시스템 파티션 입니다." 라는 내용의 화면이 나타나는데 여기에서 ENTER 키를 누릅니다.

7. "설치 프로그램에서 다음 파티션을 지웁니다." 라는 내용이 화면에 나타납니다. 파티션을 제거하려면 "L" 키를 누릅니다.

주의: "L" 키를 누르면 해당 파티션의 모든 데이터가 제거됩니다.

8. 5 번의 화면이 다시 나타나고 화면 하단의 현재 파티션 정보에는 바로 이전에 파티션을 제거한 드라이브가 분할되지 않은 공간으로 표시됩니다.

9. F3 키를 누릅니다.

10. "Windows 2000의 설치가 완료되지 않았습니다." 라는 메시지가 나타나면 다시 F3키를 누릅니다.

위와 같이 진행한 후에 윈도우 98 시동 디스크를 이용하여 시스템을 시동한 후에 Fdisk 명령을 이용하여 파티션을 새로 만듭니다.

참고 : http://www.microsoft.com/korea/support/kb/K001520.htm